Папагај Какапо: Геномско секвенцирање користи Програму очувања

Какапо папагај (познат и као „сова папагај” због својих црта лица налик сови) је критично угрожена врста папагаја која потиче из Нови Зеланд. То је необична животиња јер је најдуже живућа птица на свету (може да доживи и до 90 година). Тежи око 3-4 кг, уједно је и најтежи, једини нелетећи и ноћни папагај у свет.  

Какапо је настањивао Нови Зеланд од њихове еволуције у изолација али њихова становништво брзо опадао. Седамдесетих година прошлог века било је познато да постоји само 1970 мушких какапа. Постојање женки Какапо потврђено је 18. Захваљујући интензивном управљању очувањем, Какапо папагаји су доведени са ивице изумирања. Њихов број је био 1980 у 51. Данас је живо 1995 какапо^1,2.  

Да би се помогло очувању, пројекат Какапо125+ је настао 2015. године како би се секвенционирали геноми 125 живих какапо-а плус неке важне недавно преминуле особе. Идеја је била да се побољша генетско управљање какапом, посебно да се реши низак репродуктивни учинак (неплодност) и болест која омета опоравак. Потпуна монтажа референтног генома појединца какапо на нивоу хромозома завршена је 2018.³.  

У студији објављеној 29^th Августа 2023, истраживачки тим је известио о секвенцирању генома скоро целе популације какапо (од 2018.) од 169 какапоа, од 125 живих појединаца и 44 ускладиштена узорка. Подаци на нивоу популације повезују генетску разноврсност међу врстама са специфичним секвенцама ДНК које су повезане са особинама као што су подложност болестима, раст пилића итд. Ово би могло помоћи да се раније идентификују здравствени ризици како би се планирао третман прилагођен индивидуалној какапо птици. Овај приступ за идентификацију специфичних генетских особина кључних за опстанак могао би се пренамијенити за управљање очувањем других угрожени врста^4,5.  

*** 

Референце:  

1. Одељење за конзервацију. Влада НЗ. Какапо Рецовери. Доступно на  https://www.doc.govt.nz/our-work/kakapo-recovery/ 

2. Природњачки музеј. Необични какапо на Новом Зеланду повучен је са ивице изумирања. https://www.nhm.ac.uk/discover/new-zealands-quirky-kakapo-are-pulled-back-from-extinction.html 

3. Одељење за конзервацију. Влада НЗ. Какапо125+ секвенцирање гена https://www.doc.govt.nz/our-work/kakapo-recovery/what-we-do/research-for-the-future/kakapo125-gene-sequencing/ 

4. Универзитет Отаго 2023. Вести – Спашавање врста од изумирања – висококвалитетно секвенционирање какапо популација пружа пробој у разумевању кључне генетике очувања. Доступно на https://www.otago.ac.nz/news/otago0247128.html Приступљено 29. августа 2023.  

5. Гухлин, Ј., Ле Лец, МФ, Волд, Ј. ет ал. Геномика какапоа на нивоу целе врсте пружа алате за убрзање опоравка. Нат Ецол Евол (2023). https://doi.org/10.1038/s41559-023-02165-y  Препринт на биоРкив дои: https://doi.org/10.1101/2022.10.22.513130  

***